豆腐的营养价值极高，但长期多吃豆腐不一定有益健康，还有可能会促使一些疾病的发生，尤其是男性朋友还会伤肾杀精，因此对于豆腐的食用一定要小心谨慎，不可长期过量食用豆腐。
1、多食豆腐会伤肾
在正常情的况下，人吃进体内的植物蛋白质经过代谢后，最后大部分成为含氮废物，由肾脏排出体外。人到中年，肾脏排泄废物的能力下降，此时若不注意饮食，大量食用豆腐，摄入过多的植物性蛋白质势必会使体内生成的含氮废物增多，加重肾脏的负担，不利于身体健康。
2、对精子有害
英国科学家实验室初步研究发现：大豆中一种植物化学物质可能对精子有害。实验显示，能模仿雌激素作用的染料木素影响小鼠的精子，而人类精子对染料木素的敏感性超过小鼠精子。”因此少量的这种化学物质就可以破坏男性精子，在精子游向卵子时令精子“消耗殆尽”，失去生育能力。
3、会促使痛风发作
豆腐含嘌呤较多，嘌呤代谢失常的痛风病人和血尿酸浓度增高的患者，多吃豆腐易导致痛风发作。
4、容易导致碘缺乏
制作豆腐的大豆含有的皂角甙，会加速体内碘的排泄。长期过量食用豆腐很容易引起碘缺乏，导致碘缺乏病。
5、导致动脉硬化
豆制品含有极为丰富的蛋氨酸，蛋氨酸在酶的作用下可转化为半胱氨酸。它会损伤动脉管壁内皮细胞，使胆固醇和甘油三酯沉积于动脉壁上，导致动脉硬化形成。